Träger des Familienzentrums Monikahaus ist der Sozialdienst katholischer Frauen Frankfurt e.V. Der Verein wird von einem ehrenamtlichen Vorstand und einer hauptamtlichen Geschäftsführerin geleitet. Dies sind Brigitte Weber (Vorstandsvorsitzende), Gudrun Nagel-Nicklas (Vorstandsmitglied), Katharina Wallenborn (Vorstandsmitglied) und Heike Sienel (Geschäftsführerin). Die Aufgaben des Vorstands und der Geschäftsführung sind in der Satzung geregelt.
Der geistliche Beirat ist Dr. Stefan Scholz.
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